Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Psme4Q5SSW2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Psme4Q5SSW2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms