Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Znf608Q56A10 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms