Protein–RNA interactions for Protein: Q4VBF2

R3hdm4, R3H domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3hdm4Q4VBF2 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
R3hdm4Q4VBF2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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