Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Carmil2Q3V3V9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms