Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim80Q3V061 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim80Q3V061 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms