Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Capn13Q3UW68 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms