Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
E330014E10RikQ3UL33 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms