Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms