Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 C030010L15Rik-201ENSMUST00000181465 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28701-201ENSMUST00000189778 1010 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14152-201ENSMUST00000127020 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtpbp6Q3U6U5 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms