Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Otud5Q3U2S4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Otud5Q3U2S4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Otud5Q3U2S4 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Otud5Q3U2S4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud5Q3U2S4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Otud5Q3U2S4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Otud5Q3U2S4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Otud5Q3U2S4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Otud5Q3U2S4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Otud5Q3U2S4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud5Q3U2S4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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