Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kdm4dQ3U2K5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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