Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LcorlQ3U285 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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LcorlQ3U285 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LcorlQ3U285 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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