Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trappc10Q3TLI0 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trappc10Q3TLI0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms