Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Rpusd3Q14AI6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rpusd3Q14AI6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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