Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttc21bQ0HA38 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Ttc21bQ0HA38 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms