Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Hspg2Q05793 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms