Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Top1Q04750 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Top1Q04750 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Top1Q04750 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Top1Q04750 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Top1Q04750 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms