Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Mmp11Q02853 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms