Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cacna1sQ02789 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms