Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VcpQ01853 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VcpQ01853 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VcpQ01853 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VcpQ01853 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VcpQ01853 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms