Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Mc1rQ01727 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Mc1rQ01727 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms