Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms