Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Taf1bP97358 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms