Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sycp3P70281 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sycp3P70281 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms