Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Rps11P62281 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms