Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Fgd1P52734 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms