Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LtbrP50284 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LtbrP50284 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms