Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxc13P50207 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms