Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Prox1P48437 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Prox1P48437 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms