Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ThpoP40226 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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