Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lig1P37913 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lig1P37913 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lig1P37913 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms