Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ly6dP35459 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ly6dP35459 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ly6dP35459 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ly6dP35459 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ly6dP35459 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms