Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grin1P35438 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms