Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nedd1P33215 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nedd1P33215 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms