Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Aldh1a1P24549 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Aldh1a1P24549 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms