Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RarbP22605 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RarbP22605 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RarbP22605 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms