Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pou3f1P21952 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pou3f1P21952 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Pou3f1P21952 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pou3f1P21952 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms