Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tnnc1P19123 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms