Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Sptan1P16546 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Sptan1P16546 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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