Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ass1P16460 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ass1P16460 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ass1P16460 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms