Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PrphP15331 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PrphP15331 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PrphP15331 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms