Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Clec2g-202ENSMUST00000075789 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm16434-202ENSMUST00000177712 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm6676-202ENSMUST00000178376 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 A530053G22Rik-204ENSMUST00000204579 536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm42995-201ENSMUST00000197047 1330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Tceal9-202ENSMUST00000113115 888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm37809-201ENSMUST00000195050 931 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm42734-201ENSMUST00000201656 878 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chrm1P12657 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms