Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Hoxd4P10628 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms