Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Amd1P0DMN7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms