Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Spta1P08032 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Spta1P08032 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms