Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
H2-Ab1P01921 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms