Protein–RNA interactions for Protein: P01739

T-cell receptor alpha chain V region 2B4, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01739 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
P01739 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
P01739 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
P01739 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
P01739 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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