Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ifnb1P01575 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ifnb1P01575 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ifnb1P01575 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ifnb1P01575 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ifnb1P01575 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ifnb1P01575 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ifnb1P01575 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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