Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AurkcO88445 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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AurkcO88445 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms