Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hcn4O70507 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms